Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNIH3Q8TBE1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNIH3Q8TBE1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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