Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEZ2

VPS37A, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37AQ8NEZ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VPS37AQ8NEZ2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS37AQ8NEZ2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms