Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA4Q8NEY3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms