Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND24

RNF214, RING finger protein 214, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF214Q8ND24 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF214Q8ND24 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF214Q8ND24 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF214Q8ND24 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF214Q8ND24 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF214Q8ND24 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms