Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SMG8Q8ND04 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMG8Q8ND04 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMG8Q8ND04 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMG8Q8ND04 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMG8Q8ND04 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMG8Q8ND04 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMG8Q8ND04 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG8Q8ND04 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms