Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNTD1Q8N9Z9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms