Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6N3

C1orf52, UPF0690 protein C1orf52, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf52Q8N6N3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf52Q8N6N3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf52Q8N6N3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf52Q8N6N3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf52Q8N6N3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf52Q8N6N3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf52Q8N6N3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf52Q8N6N3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf52Q8N6N3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf52Q8N6N3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms