Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM199Q8N511 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM199Q8N511 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM199Q8N511 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms