Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RYBPQ8N488 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms