Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NELFCDQ8IXH7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NELFCDQ8IXH7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms