Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUDCD3Q8IVD9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms