Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC71Q8IV32 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC71Q8IV32 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms