Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF13Q86YI8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHF13Q86YI8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF13Q86YI8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF13Q86YI8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF13Q86YI8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF13Q86YI8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF13Q86YI8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF13Q86YI8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF13Q86YI8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms