Protein–RNA interactions for Protein: Q86XF0

DHFR2, Dihydrofolate reductase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHFR2Q86XF0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHFR2Q86XF0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHFR2Q86XF0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHFR2Q86XF0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms