Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX8Q7RTT4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX8Q7RTT4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX8Q7RTT4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms