Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HS2ST1Q7LGA3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms