Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY3Q7L099 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RUFY3Q7L099 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms