Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA6Q6ZSJ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHISA6Q6ZSJ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms