Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBSNQ6UWP8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBSNQ6UWP8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms