Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6Q795 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6Q795 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6Q795 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6Q795 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6Q795 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6Q795 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6Q795 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6Q795 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6Q795 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6Q795 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6Q795 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6Q795 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6Q795 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6Q795 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6Q795 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6Q795 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6Q795 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6Q795 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6Q795 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6Q795 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6Q795 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6Q795 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6Q795 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6Q795 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6Q795 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6Q795 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6Q795 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6Q795 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6Q795 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6Q795 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6Q795 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6Q795 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6Q795 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6Q795 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6Q795 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6Q795 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6Q795 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6Q795 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6Q795 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6Q795 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6Q795 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6Q795 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6Q795 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6Q795 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6Q795 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6Q795 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6Q795 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6Q795 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6Q795 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6Q795 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6Q795 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6Q795 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6Q795 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6Q795 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6Q795 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6Q795 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6Q795 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6Q795 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6Q795 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6Q795 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6Q795 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6Q795 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6Q795 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6Q795 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6Q795 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6Q795 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms