Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJP8

DCLRE1A, DNA cross-link repair 1A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1AQ6PJP8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLRE1AQ6PJP8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLRE1AQ6PJP8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLRE1AQ6PJP8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLRE1AQ6PJP8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCLRE1AQ6PJP8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCLRE1AQ6PJP8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCLRE1AQ6PJP8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCLRE1AQ6PJP8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCLRE1AQ6PJP8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DCLRE1AQ6PJP8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCLRE1AQ6PJP8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms