Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC23A3Q6PIS1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC23A3Q6PIS1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms