Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A1Q6PCB7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms