Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEPROQ6NW34 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms