Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPT2

FAM71E1, Protein FAM71E1, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E1Q6IPT2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71E1Q6IPT2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71E1Q6IPT2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM71E1Q6IPT2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms