Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC9A4Q6AI14 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC9A4Q6AI14 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms