Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LEMD1Q68G75 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms