Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCTD16Q68DU8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KCTD16Q68DU8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms