Protein–RNA interactions for Protein: Q5W5X9

TTC23, Tetratricopeptide repeat protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23Q5W5X9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC23Q5W5X9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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TTC23Q5W5X9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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TTC23Q5W5X9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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TTC23Q5W5X9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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TTC23Q5W5X9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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TTC23Q5W5X9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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TTC23Q5W5X9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TTC23Q5W5X9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTC23Q5W5X9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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