Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC183Q5T5S1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC183Q5T5S1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms