Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDSS1Q5T2R2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms