Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC38Q5R3I4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC38Q5R3I4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms