Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRMS1LQ5PSV4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms