Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQF7

LINC01556, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01556, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01556Q5JQF7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01556Q5JQF7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01556Q5JQF7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01556Q5JQF7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01556Q5JQF7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01556Q5JQF7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01556Q5JQF7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01556Q5JQF7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01556Q5JQF7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01556Q5JQF7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01556Q5JQF7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01556Q5JQF7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01556Q5JQF7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01556Q5JQF7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms