Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3AQ59EK9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms