Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN20Q4JDL3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms