Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N8

SLC9C1, Sodium/hydrogen exchanger 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C1Q4G0N8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9C1Q4G0N8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC9C1Q4G0N8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC9C1Q4G0N8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9C1Q4G0N8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms