Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNPY1Q3B7I2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNPY1Q3B7I2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNPY1Q3B7I2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNPY1Q3B7I2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNPY1Q3B7I2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY1Q3B7I2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY1Q3B7I2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY1Q3B7I2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY1Q3B7I2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY1Q3B7I2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY1Q3B7I2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY1Q3B7I2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY1Q3B7I2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNPY1Q3B7I2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNPY1Q3B7I2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNPY1Q3B7I2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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