Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGSM1Q2NKQ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SGSM1Q2NKQ1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms