Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC142Q17RM4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC142Q17RM4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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