Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDO1Q16878 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDO1Q16878 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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