Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN21Q16825 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN21Q16825 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms