Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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RTN1Q16799 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
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RTN1Q16799 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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RTN1Q16799 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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RTN1Q16799 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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RTN1Q16799 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTN1Q16799 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
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RTN1Q16799 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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RTN1Q16799 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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RTN1Q16799 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
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RTN1Q16799 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTN1Q16799 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTN1Q16799 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
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RTN1Q16799 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTN1Q16799 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RTN1Q16799 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTN1Q16799 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RTN1Q16799 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTN1Q16799 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RTN1Q16799 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTN1Q16799 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTN1Q16799 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
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RTN1Q16799 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTN1Q16799 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTN1Q16799 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTN1Q16799 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTN1Q16799 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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