Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF239Q16600 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF239Q16600 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF239Q16600 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF239Q16600 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF239Q16600 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF239Q16600 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF239Q16600 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF239Q16600 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF239Q16600 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF239Q16600 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF239Q16600 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF239Q16600 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF239Q16600 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF239Q16600 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF239Q16600 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF239Q16600 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF239Q16600 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF239Q16600 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF239Q16600 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF239Q16600 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF239Q16600 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF239Q16600 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF239Q16600 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF239Q16600 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF239Q16600 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF239Q16600 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF239Q16600 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF239Q16600 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF239Q16600 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF239Q16600 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF239Q16600 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF239Q16600 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF239Q16600 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF239Q16600 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF239Q16600 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF239Q16600 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF239Q16600 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF239Q16600 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF239Q16600 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF239Q16600 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF239Q16600 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF239Q16600 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF239Q16600 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF239Q16600 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF239Q16600 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF239Q16600 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF239Q16600 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF239Q16600 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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