Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NTRK3Q16288 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NTRK3Q16288 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NTRK3Q16288 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NTRK3Q16288 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NTRK3Q16288 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NTRK3Q16288 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NTRK3Q16288 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NTRK3Q16288 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NTRK3Q16288 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NTRK3Q16288 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NTRK3Q16288 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NTRK3Q16288 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NTRK3Q16288 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NTRK3Q16288 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NTRK3Q16288 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NTRK3Q16288 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NTRK3Q16288 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NTRK3Q16288 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NTRK3Q16288 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NTRK3Q16288 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NTRK3Q16288 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NTRK3Q16288 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NTRK3Q16288 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NTRK3Q16288 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NTRK3Q16288 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NTRK3Q16288 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NTRK3Q16288 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NTRK3Q16288 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NTRK3Q16288 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NTRK3Q16288 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NTRK3Q16288 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NTRK3Q16288 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NTRK3Q16288 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NTRK3Q16288 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NTRK3Q16288 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NTRK3Q16288 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NTRK3Q16288 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NTRK3Q16288 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NTRK3Q16288 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NTRK3Q16288 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NTRK3Q16288 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NTRK3Q16288 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NTRK3Q16288 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NTRK3Q16288 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NTRK3Q16288 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NTRK3Q16288 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NTRK3Q16288 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NTRK3Q16288 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NTRK3Q16288 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NTRK3Q16288 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NTRK3Q16288 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NTRK3Q16288 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NTRK3Q16288 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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