Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEBPEQ15744 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEBPEQ15744 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEBPEQ15744 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEBPEQ15744 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEBPEQ15744 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEBPEQ15744 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEBPEQ15744 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEBPEQ15744 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEBPEQ15744 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEBPEQ15744 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEBPEQ15744 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEBPEQ15744 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEBPEQ15744 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEBPEQ15744 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEBPEQ15744 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEBPEQ15744 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms