Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR1Q15399 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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