Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS1Q14691 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS1Q14691 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS1Q14691 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS1Q14691 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms