Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCARF1Q14162 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms