Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAPGEF1Q13905 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAPGEF1Q13905 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
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